Uno de los objetivos de la CECT, incluido en su política de calidad, es facilitar el trabajo de los laboratorios que utilizan cultivos microbianos para ejercicios de intercomparación, controles de calidad, etc. Éstos requieren cultivos que presenten el patrón típico de la especie. Sin embargo, en algunas ocasiones las cepas salvajes o almacenadas en colecciones de cultivo durante largo tiempo pueden no presentar para algún ensayo determinado las características que se consideran típicas de la especie a la que pertenecen. También puede ocurrir que la cepa que se depositó en su día como cepa tipo no ha resultado ser la más “típica”. Estos hechos pueden resultar un problema para los laboratorios que realizan ensayos de control de calidad si no disponen de la información que necesitan sobre el comportamiento de las diferentes cepas de una especie.
En la CECT se conservan numerosas cepas pertenecientes a una misma especie, por lo que se pueden seleccionar aquellas que muestren el perfil característico. Bajo la supervisión de personal experto en los diferentes grupos microbianos, se ha estudiado el comportamiento de varias cepas de algunas de las especies más solicitadas que existen en la CECT como cultivos liofilizados. Tras su reconstitución, y una vez comprobada su pureza y autenticidad, se las ha inoculado en los diferentes medios de cultivo selectivos y diferenciales para comprobar si las colonias mostraban la morfología típica descrita para dicha especie en cada medio. Asimismo, se han empleado los sistemas miniaturizados de identificación adecuados al grupo en el que se incluye la especie en cuestión para comprobar la bondad del ajuste del perfil bioquímico obtenido al descrito para la misma. Con esta información se han podido seleccionar aquellas cepas que han presentado un comportamiento más típico para cada una de las diferentes especies.
De esta forma, la CECT puede ofrecer a sus usuarios una serie de “cepas certificadas” que pertenecen a las especies más solicitadas por los laboratorios para los ensayos de control de calidad y ejercicios de intercomparación. Dichas cepas presentan un perfil típico tanto por el aspecto de sus colonias en los medios de cultivo selectivos y diferenciales, como por su perfil bioquímico empleando sistemas multitest miniaturizados de amplio uso (tira API). Durante el periodo de lanzamiento, su coste será el mismo que el de las cepas sin certificar.
Por el momento se encuentran disponibles las siguientes cepas:

• Pseudomonas aeruginosa, (Schroeter 1872) Migula 1900 CECT 111
• Staphylococcus aureus subsp. aureus, Rosenbach 1884 CECT 240
• Enterococcus faecium, (Orla-Jensen 1919) Schleifer and Kilpper-Bälz 1984 CECT 410
• Salmonella enterica subsp. enterica, serovar Typhimurium, (ex Kauffmann and Edwards 1952) Le Minor and Popoff 1987 CECT 443
• Enterococcus faecalis, (Andrewes and Horder 1906) Schleifer and Kilpper-Bälz 1984 CECT 481
• Escherichia coli, (Migula 1895) Castellani and Chalmers 1919 CECT 515
• Enterococcus faecalis, (Andrewes and Horder 1906) Schleifer and Kilpper-Bälz 1984 CECT 795
• Listeria innocua, Seeliger 1983 CECT 910
• Listeria monocytogenes, (Murray et al. 1926) Pirie 1940 CECT 935
• Candida albicans, (Robin) Berkhout. A CECT 1392