Los logros y circunstancias más significativos de esta etapa son:
En 1983 ingresa en la recién creada Organización Europea de Colecciones de Cultivo (ECCO).
En 1985 se publica la segunda edición del Catálogo de Cepas, que incluía en esta ocasión 805 cepas (482 bacterias y 323 hongos), y en 1990 la tercera, por primera vez en inglés, y que incluía información obtenida a través de la Red de Información Microbiana Europea (MINE), el Centro de Información para Colecciones Europeas de Cultivos, la Red de Datos de Cepas Microbianas (MSDN), el Centro de Datos Mundial (WDC), listas de abreviaturas y de acrónimos, una lista de 967 cepas bacterianas y 814 cepas de hongos; un índice numérico de las cepas de la CECT, medios de cultivo y una relación de aplicaciones.
Desde 1991 constituye uno de los servicios de la Universitat de València y así está recogido en su página web. En 1992, y ante una petición por parte del Ministerio de Industria, que deseaba contar en España con una institución reconocida internacionalmente para tramitar solicitudes de patentes en las que intervienen microorganismos, la CECT realizó las correspondientes gestiones y obtuvo el reconocimiento como Autoridad Internacional de Depósito de microorganismos para fines de patentes según el tratado de Budapest (IDA). La CECT es por tanto la única autoridad internacional de depósito de bacterias, hongos filamentosos y levaduras para fines de patentes existente en España.
A partir de 2000 la CECT ofrece un catálogo on-line que contiene la misma información que los catálogos impresos, pero que se actualiza constantemente con los nuevos depósitos públicos y en el que se recogen las variaciones en el estatus taxonómico de las cepas.
Actualmente, la Colección Española de Cultivos Tipo sigue siendo la única colección de microorganismos oficial y de carácter público en España que mantiene y suministra bacterias, hongos filamentosos y levaduras. Tras el fallecimiento del Prof. Federico Uruburu en septiembre de 2003, fue nombrada directora la Prof. Esperanza Garay Aubán, catedrática de Microbiología de la Universitat de València.