Identificación de Hongos Filamentosos y Levaduras

La identificación de hongos filamentosos en la CECT combina técnicas fenotípicas y técnicas moleculares. Estas últimas están basadas en el análisis de diferentes regiones del DNA ribosómico (secuenciación de los dominios D1/D2 del gen 26S rDNA y secuenciación y posterior restricción de la zona del DNA ribosómico que comprende los espacios intergénicos ITS1 e ITS2 y que incluye el gen 5,8S). Adicionalmente, en función del grupo del microorganismo a identificar, se utiliza la secuenciación de varios genes implicados en el mantenimiento del metabolismo de la célula (β-Tubulina y Factor de translación elongación 1α).

La identificación de levaduras se lleva a cabo empleando fundamentalmente las mismas técnicas moleculares mencionadas anteriormente para la identificación de hongos filamentosos.

Dependiendo de las características del aislado, pueden variar las técnicas y el tiempo empleados en la identificación.

Identificación de procariotas (Bacterias y Arqueas)

La CECT ofrece un servicio de identificación de aislados de procariotas basado fundamentalmente en la secuenciación parcial del gen 16S rRNA, junto con una caracterización morfológica y fenotípica básica.
También es posible solicitar la secuencia completa del gen 16S rRNA, así como la realización de un estudio filogenético detallado mediante el estudio de dicha secuencia.

La CECT ofrece además la posibilidad de realizar pruebas adicionales, incluyendo el ribotipado automático (Riboprinter), la caracterización fenotípica mediante sistemas miniaturizados, la composición de ácidos grasos celulares (MIDI) y el análisis de proteínas mediante MALDI-TOF.

En la caracterización de cepas bacterianas utilizando los sistemas miniaturizados API e ID 32 de Biomérieux, la CECT adjuntará el perfil bioquímico obtenido y el informe que se genera al contrastar dicho perfil con los existentes en las bases de datos correspondientes.
(nota: como en cualquier otro sistema de identificación algunos aislados dan lugar a resultados no concluyentes, que aparecerán comentados en el informe según se trate de baja discriminación, identificación no fiable, perfil dudoso o perfil inaceptable).

El sistema MIDI (Sherlock Microbial Identification System) para el estudio de la composición de ácidos grasos celulares permite la identificación de las cepas que pertenezcan a las especies registradas en las librerías de MIDI, así como la caracterización de aislados proporcionando la composición relativa de sus ácidos grasos celulares.

El análisis de proteínas celulares mediante MALDI-TOF permite la obtención de perfiles útiles para identificar y agrupar aislados.

Los pasos a seguir para solicitar una identificación de aislados a la CECT son los siguientes:

• Descargar y cumplimentar el formulario de identificación de cepas (un formulario por cepa a identificar):
  Formato MSWord Formato pdf


• Avisar a la CECT escribiendo un e-mail a la dirección de correo electrónico del grupo microbiano al que pertenezca el microorganismo con antelación al envío de la cepa
• Preparar un cultivo puro de la cepa a identificar
• Rotular los tubos o placas con la designación de la cepa indicada en la ficha de identificación
• Preparar el paquete para el envío de las cepas según las normativas de seguridad aplicables
• Realizar el envío de las cepas por mensajería para minimizar el tiempo de transporte