Nuevos servicios de Identificación y Caracterización de cepas

La CECT ofrece la caracterización de cepas bacterianas y levaduriformes utilizando los sistemas miniaturizados API e ID 32 de Biomérieux. En todos los casos, la CECT adjuntará el perfil bioquímico obtenido y el informe que se genera al contrastar dicho perfil con los existentes en la base de datos correspondientes (nota: como en cualquier otro sistema de identificación algunos aislados dan lugar a resultados no concluyentes, que aparecerán comentados en el informe según se trate de baja discriminación, identificación no fiable, perfil dudoso o perfil inaceptable).

Además, la CECT ha adquirido y puesto a punto el sistema MIDI (Sherlock Microbial Identification System) para el estudio de la composición de ácidos grasos celulares. Este sistema permite la identificación de las cepas que pertenezcan a las especies registradas en las librerías de MIDI, así como la caracterización de aislados proporcionando la composición relativa de sus ácidos grasos celulares.

En ambos casos las principales ventajas frente a otros sistemas ofertados son su bajo coste y un menor tiempo medio de entrega de resultados.

Identificación de eucariotas (Hongos Filamentosos y Levaduras)

La identificación de hongos filamentosos en la CECT combina técnicas fenotípicas y técnicas moleculares. Estas últimas están basadas en el análisis de diferentes regiones del DNA ribosómico (secuenciación de los dominios D1/D2 del gen 26S rDNA y secuenciación y posterior restricción de la zona del DNA ribosómico que comprende los espacios intergénicos ITS1 e ITS2 y que incluye el gen 5,8S). Adicionalmente, en función del grupo del microorganismo a identificar, se utiliza la secuenciación de varios genes implicados en el mantenimiento del metabolismo de la célula (β-Tubulina y Factor de translación elongación 1α). La identificación de levaduras se lleva a cabo empleando fundamentalmente las mismas técnicas moleculares mencionadas anteriormente para la identificación de hongos filamentosos. Dependiendo de las características del aislado, pueden variar las técnicas y el tiempo empleados en la identificación.

Identificación de procariotas (Bacterias y Arqueas)

La CECT ofrece un servicio de identificación de aislados de procariotas basado fundamentalmente en la secuenciación parcial del gen 16S rRNA, junto con una caracterización morfológica y fenotípica básica. La CECT ofrece además la posibilidad de realizar pruebas adicionales, incluyendo el ribotipado automático (Riboprinter), la composición de ácidos grasos celulares (MIDI), y la caracterización fenotípica mediante sistemas miniaturizados. En todos estos casos se debe consultar previamente la disponibilidad a través del correo-e (bacterias@cect.org).

Los pasos a seguir para solicitar una identificación de aislados a la CECT son los siguientes:

• Descargar y cumplimentar el formulario de identificación de cepas (un formulario por cepa a identificar):
  Formato MSWord Formato pdf


• Avisar a la CECT escribiendo un e-mail a la dirección de correo electrónico del grupo microbiano al que pertenezca el microorganismo con antelación al envío de la cepa
• Preparar un cultivo puro de la cepa a identificar
• Rotular los tubos o placas con la designación de la cepa indicada en la ficha de identificación
• Preparar el paquete para el envío de las cepas según las normativas de seguridad aplicables
• Realizar el envío de las cepas por mensajería para minimizar el tiempo de transporte